基地重组后最直接的影响是你会失去大部分战舰和资源，只保留30%的仓储资源和工程舰，其他舰船会被自动退役。这个操作相当于换个地方重新开始，所以前期积累的舰队几乎要全部重建。重组后还会自动退出当前同盟，前哨站和采矿平台等建筑也会被摧毁，需要重新部署。冷却时间根据基地等级决定，4本之前是48小时，4本之后延长到96小时，期间无法再次重组。
重组后的资源保留规则需要注意，系统只会留下仓储上限的30%，而不是现有资源的30%。如果你的仓库原本是满的，重组后能保住一部分资源；但如果之前资源已经消耗得差不多，重组后可能面临资源紧缺的问题。建议在重组前尽量用掉多余资源，比如升级建筑或生产舰船，避免浪费。工程舰是唯一不会被退役的舰船，所以重组前可以多造几艘工程舰，方便后续快速恢复采矿能力。
基地重组的高机动性虽然能让你快速转移到新区域，但代价不小。除了资源和舰船损失，还需要重新规划采矿和防御布局。新位置可能周围资源更丰富，也可能更贫瘠，存在一定随机性。如果只是为了躲避敌人或争夺矿区，可以先考虑前哨站迁移等更温方式。重组更适合彻底改变发展策略或脱离当前同盟时使用，不要频繁操作，否则重建成本会拖慢整体进度。
冷却时间内无法再次重组，所以一定要选好目标位置。如果重组后发现新区域不合适，只能等待冷却结束，这段时间会非常被动。建议提前用侦查舰探索周边环境，确认资源分布和敌对势力情况。重组后优先修复港口和生产线，尽快补充护卫舰和驱逐舰保障安全，再逐步恢复采矿和基建。重组是战略选择而非应急手段，谨慎决策才能减少发展断层。
最后要注意，重组后会自动退出同盟，如果需要集体行动，记得提前和盟友沟通。单独行动时更容易被其他玩家针对，所以重建防御体系是重中之重。基地等级和关键建筑（如指挥中心、工业区）会保留，利用这些基础快速恢复战斗力。虽然过程艰难，但合理的重组能帮你跳出僵局，在新的星域找到更有利的发展空间。