男女主角的技能差异主要体现在攻击类型和技能效果上。男主角属于物理攻击类型，技能偏向于高爆发和单体输出；女主角则属于法术攻击类型，技能更注重群体伤害和控制效果。这种基础设定决定了他们在阵容搭配和战斗定位上的不同方向。虽然攻击类型不同，但两者都具备化身系统，可以通过特定化身改变技能形态和战斗风格。
男主角的物理攻击特性使其更适合搭配蜀国或群雄阵容，尤其是与吕布等物理系武将形成联动。其技能通常附带暴击率提升、命中率加成等效果，例如龙胆亮银枪的暴击增幅和丈八蛇矛的多段伤害机制。这类技能在对抗前排坦克型敌人时表现突出，能快速突破敌方防御。而女主角的法术攻击则更适配魏国、吴国等以法术输出为主的阵容，技能常带有灼烧、冰冻等持续伤害或控制效果，例如天香小乔的心火灵火双状态叠加，能同时削弱敌方输出和生存能力。
从技能触发机制来看，男主角的物理技能往往需要特定站位配合，例如处于1号位可优先出手触发连击效果，而女主角的法术技能则更依赖回合积累，通过多回合叠加异常状态实现爆发。两者在神兵选择上也存在明显区别：男主角更适合搭配增加暴击的雌雄双股剑或提升连击率的诸葛连弩，女主角则倾向选择能强化法术伤害的墨羽扇或增强控制的苍叶绿绮琴。这种差异使得男主角在PVP速攻流中更具优势，而女主角在持久战中能发挥更大作用。
尽管存在诸多差异，但男女主角在核心养成机制上保持高度一致。他们都拥有完整的升星体系，通过关卡解锁可提升至金色品质；都依赖时装系统改变技能形态，且共享部分通用化身如曹丕、文丑等。在实战中，两者的技能都能与特定武将产生联动，例如男主角配合张飞可增强前排压制力，女主角搭配陆逊能提升群体伤害效率。这种设计既保留了角色特性，又确保了战斗体系的平衡性。
物理系爱好者或追求速攻的玩家更适合男主角，而喜欢策略性控场和持续输出的玩家则可能更青睐女主角。游戏进程推进，通过化身系统和时装搭配，两者都能适应多种战斗场景，差异会逐渐缩小。最终决定因素仍在于玩家对角色特性的理解与运用程度。