放开那三国3的主线章节分布与隐藏点探索是游戏核心玩法之一。目前已公开的章节主线副本覆盖从第一章至第三十五章，每章地图均设有固定剧情关卡、隐藏事件及异兽收集点。第二章乱世之前奏、第五章西凉上将、第十章汉室余晖等章节名称直接对应三国历史事件，玩家需按顺序推进，章节解锁条件为通关前一章并达到推荐战力。部分章节如夜鸦之影需完成前置线索任务才能触发隐藏点，而智取荆州等特殊玩法章节则需通过主线进度或活动开放。
隐藏点通常位于地图边缘或特殊地形处，例如第二章的隐藏点在左上角石碑旁，第五章隐藏点位于左下角圆盘旁的树林，进入后还可能存在嵌套的次级隐藏区域。第十章隐藏点需从雕像背后的山峦阴影处进入，击败巨狼后可点亮游历簿。第十七章隐藏点战熊、第十九章野猪、第二十五章冰雪巨狼等异兽均需通过隐藏点触发战斗。部分章节如第二十三章铁骑勤王的隐藏点为动态事件，需先拾取地图散落的纸页线索才能解锁。
主线副本中的彩蛋与资源收集点需注意交互细节。每章地图存在可破坏的木桶、宝箱及NPC对话事件，例如守卫宝箱的于禁具有高防御和反弹特性，需针对性调整阵容。答题类NPC提供知识问答奖励，而精炼工匠和旅行商人则提供材料兑换服务。部分章节如第十八章夜探长安的隐藏点位于湖水右侧吕布军校尉下方，需手动探索而非自动寻路触发。
后期章节如第三十一章巨蝎、第三十四章未公开区域对阵容搭配要求较高，建议优先培养前排护卫和群体输出武将。魔魂塔、攻城略地等玩法会随第十六章、第十八章通关后开放，提供饰品强化资源。主线推进至第三十五章后，部分隐藏异兽和支线任务会解锁额外剧情片段，但需注意部分章节名称可能因测试阶段调整而存在差异。
探索过程中需合理分配体力，优先完成章节满星条件（无武将阵亡、限时通关）以解锁宝箱奖励。游历簿中的异兽收集进度会影响成就奖励，建议在卡关时回溯已通关章节查漏补缺。主线剧情与隐藏点的关联性较强，部分武将技能如青囊秘要的恢复效果在持久战中能显著提升探索效率。