英雄副本作为火影忍者：忍者新世代中的高难度挑战，需要玩家在阵容搭配、资源分配和战斗策略上做到精准把控。通关英雄副本的核心在于合理利用自动战斗功能、优先提升天赋性价比、高效获取声望与铜币。第一章所有副本通关后可开启自动战斗，大幅降低重复刷本的枯燥感；资源分配顺序应为天赋＞装备＞通灵，因天赋对战力提升最显著；声望可通过试炼之地、武斗祭、丰饶之间及组织叛忍活动获取，而铜币则需每日完成排行榜点赞并优先强化修行之路的爬塔收益。
战斗技巧的细节决定了副本通关的稳定性。X轴技能释放时机尤为关键，扫地类技能（如小南的3个技能、疾风传宁次的回天等）可在敌人落地时重置保护并继续连招，而非扫地技能需确保敌人浮空高度足够。替身术的释放需避免被对手预判，通常在对方奥义点耗尽或己方陷入被动时使用；通灵兽的霸体效果能反制敌方秘卷或技能，最佳释放时机为对方无替身状态、己方满奥义点起手或紧急避险时。秘卷选择需根据关卡特性调整，例如雷击适合起手打断，水龙卷和裂炎弹用于替身后的自我保护。
阵容构建需兼顾输出、控制和生存能力。推荐以木叶系忍者为核心，例如猿飞日斩火影继承人的减伤与吸血效果能显著提升团队容错率，搭配宇智波止水、千手柱间等养成型忍者可快速形成战力压制。低战力玩家可依赖B级鸣人的分身群攻机制，通过奥义打断和分身消耗应对高难度关卡。部分副本需特定角色破解机制，如班长（笕堇）的混乱技能可扭转战局，利用敌方高输出单位反制其队友。
每日必须完成活跃任务获取经验，通过困难副本扫荡和忍者派遣补充体力。英雄副本的关卡设计往往存在取巧点，例如3-15关卡需优先打断君麻吕和多由也的奥义，5-21关卡则依赖混乱控制小李和天天。部分副本需分阶段处理，如守护木叶玩法需在三个防御点部署不同阵容，并利用增益效果抵消敌方波风水门的最终攻势。
平民玩家应专注培养2-3名S级忍者（如凯、阿斯玛），通过月卡和活动逐步积累资源，避免分散投资。忍者考试、幻境探险等玩法能提供关键素材，而赛季制内容如秘密敕令需灵活调整阵容以适应不同赦令限制。暗部任务则建议根据战力选择单人或多